Bioinformatik/Sequenzierung

Die Dienstleistungseinheit unterstützt Projekte, die umfangreiche DNA/RNA-Sequenzierungen und bioinformatische Analysen beinhalten. Sie berät Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler des BNITM bereits in der Planungsphase von Projekten. Thorsten Thye bietet Beratung zu Sequenzierungen, Stephan Lorenzen ist für die bioinformatische Auswertung verantwortlich.

Angebotene Services:

  • Projektplanung und Durchführung
  • Aufarbeitung von Proben für die Sequenzierung
DNA- oder RNA-Sequenzierungen:
  • Genomsequenzierungen
  • Transkriptom- und Metagenomanalysen
  • Chromosome Conformation Capture
  • DNAse-seq
  • miRNA-seq
  • Amplicon sequencing
Genomweite Assoziationsstudien (GWAS)
Sequenzabgleich zur Detektion von genetischen Varianten

Ausstattung:

  • Miseq Sequencer (Illumina) – Next Generation Sequencing
  • Bioanalyzer (Agilent)
  • 4 Hochleistungsrecher mit insgesamt 100 cores und 1,3 TB RAM für bioinformatische Analysen

Kontakt

Dr. Stephan Lorenzen

Bioinformatik

Tel.: +49 40 42818- 208    
E-Mail: lorenzen(at)bnitm.de

Raum: 115

Dr. Thorsten Thye

Bioinformatik

Tel.: +49 40 42818-289    
E-Mail: thye(at)bnitm.de

Raum: 123