Virus Metagenomics and Evolution

Zu sehen ist eine schematische Übersicht über eine Beispielhafte Studie. Im oberen Teil ist aufder linken Seite ein Wald mit Fledermäusen zu sehen, in der Mitte verläuft ein Fluss mit unterschiedlichen Insekten, rechts ist eine einfach Siedlung mit kleinen Hütten und Menschen zu sehen. Verbunden sind die Fledermäuse mit Pfeilen mit den Menschen und den Insekten, die Insekten mit den Fledermäusen und den Menschen. Untersucht werden soll also der Einfluss der Fledermäuse, bzw. der Insekten auf den Menschen. Im Unteren Teil ist Beispielhaft eine Auswertung gezeigt. Hierzu sind im linken teil des Bildes mehrere Geräte zu sehen, die die Genetik der Insekten und Fledermäuse untersuchen. Ausgewertet werden am Ende die genomische Struktur, die Phylogenetische Beziehung und die geographische Auswertung.

Virus xenosurveillance by blood meal (single mosquito) metatranscriptomics.

Eine Gruppe Menschen Kopf- und Körperschmuck, sowie Gesichtsbemalung stehen auf einem Platz. Eine Frau trägt einen Korb mit bunten Blättern und Blumen auf dem Rücken und einige Menschen tragen große gelbe Palmenwedel in den Händen.

Der Amazonas der über ein steinige Flussbett fließt, am Rand des Flussbettes erhebt sich ein Regenwald.

©Dániel Cadar©Dániel Cadar©Nicolás Tinoco©Dániel Cadar

Overview

Our group investigates viral pathogens and their interactions with hosts and ecosystems through a One Health lens, integrating metagenomics and metatranscriptomics to link human, animal, and environmental health. We focus on virus discovery, zoonotic transmission, and surveillance to understand how viruses emerge and evolve. By characterising the virome of humans, wildlife, livestock, and sentinel species, we assess spillover risk and identify early signals of high-impact pathogens. We study how deforestation, urbanisation, agriculture, and climate change disrupt ecosystems and intensify host-pathogen contact. Using phylogeography, we trace viral spread across landscapes shaped by trade, migration, and ecological barriers. In response to threats like Disease X, we develop predictive models and genomic early-warning systems based on viral traits and ecological risk factors. Through global collaboration, we develop data-driven strategies to prevent spillovers, track outbreaks, and protect public and planetary health.